Zadania Oddziału Przeciwepidemicznego:

Nadzór epidemiologiczny nad zakażeniami i chorobami zakaźnymi

• Opracowywanie ognisk chorób zakaźnych, przeprowadzanie dochodzeń epidemiologicznych mających na celu ustalenie źródła i dróg szerzenia się zakażenia oraz ich likwidację, a tym samym niedopuszczenie do wystąpienia kolejnych zachorowań. 
• Prowadzenie rejestru podejrzeń i zachorowań na choroby zakaźne oraz biologicznych czynników chorobotwórczych podlegających obowiązkowi zgłaszania i rejestracji.
• Nadzór czynny w zakresie prawidłowej i systematycznej zgłaszalności chorób zakaźnych i zakażeń objętych ustawowym obowiązkiem zgłaszania do Państwowego Powiatowego Inspektora Sanitarnego w Gdańsku. 
• Opracowywanie ognisk zbiorowych zatruć pokarmowych. 
• Opracowywanie dwutygodniowych, kwartalnych, rocznych sprawozdań statystycznych dotyczących zachorowań na choroby zakaźne. 
• Udział w realizacji europejskiego programu nadzoru nad grypą „SENTINEL”. 
• Nadzór nad nosicielami chorób zakaźnych, ozdrowieńcami, osobami ze styczności. 
• Prowadzenie nadzoru epidemiologicznego w sytuacjach mogących być skutkiem ataku bioterrorystycznego. 
• Prowadzenie analizy zapadalności na choroby zakaźne. 
• Opracowywanie projektów decyzji lub wystąpień do innych organów o ich wydanie w przypadkach określonych w przepisach o zwalczaniu chorób zakaźnych. 
• Ocena sytuacji epidemiologicznej miasta Gdańska.

Nadzór sanitarno-epidemiologiczny nad placówkami opieki medycznej.

• Nadzór nad publicznymi i niepublicznymi zakładami opieki zdrowotnej, indywidualnymi praktykami lekarskimi, indywidualnymi specjalistycznymi praktykami lekarskimi, grupowymi praktykami lekarskimi, indywidualnymi praktykami pielęgniarskimi oraz laboratoriami w zakresie przestrzegania reżimu higieniczno-sanitarnego oraz stosowania procedur mających na celu minimalizowanie ryzyka wystąpienia zakażenia wewnątrzzakładowego. 
• Kontrola skuteczności procesu sterylizacji. 
• Kontrolowanie skuteczności procesów deratyzacji prowadzonych w zakładach opieki zdrowotnej. 
• Opracowywanie projektów decyzji i postanowień, prowadzenie postępowań administracyjnych i egzekucyjnych zgodnie z Kodeksem Postępowania Administracyjnego. 
• Przygotowywanie rocznych planów działalności kontrolnej oraz opracowywanie sprawozdań z ich realizacji.

Nadzór nad szczepieniami ochronnymi

• Nadzór nad wykonywaniem obowiązkowych szczepień ochronnych w zakładach opieki zdrowotnej i innych placówkach prowadzących szczepienia ochronne (np. zakładach opiekuńczych, domach dziecka).
• Kontrola prowadzonej dokumentacji dotyczącej szczepień oraz analiza wykonania obowiązkowych szczepień ochronnych. 
• Nadzór nad prawidłową gospodarką szczepionkami. 
• Podejmowanie działań przymuszających do zaszczepienia wobec osób uchylających się od obowiązku szczepień ochronnych. 
• Opracowywanie zgłaszanych niepożądanych odczynów poszczepiennych. 
• Przechowywanie i dystrybucja preparatów szczepionkowych. 
• Przygotowywanie rocznych sprawozdań ze stanu uodpornienia oraz kwartalnych sprawozdań ze zużycia szczepionek, stanu posiadanych szczepionek i ruchu kart uodpornienia. 
• Sporządzanie planów i sprawozdań dotyczących działalności kontrolnej w zakresie szczepień.